- Morala in uporabnost (1891):V tej knjigi Thomson trdi, da morala temelji na koristnosti ali načelu maksimiranja sreče in zmanjšanja bolečine. To stališče zagovarja pred različnimi kritikami, vključno z očitki, da vodi v egoizem in da ne more razložiti moralnega pomena določenih dejanj.
- Utilitaristična teorija prava (1893):Thomson v tem delu uporablja načelo uporabnosti za filozofijo prava. Trdi, da bi moralo biti pravo oblikovano tako, da spodbuja največjo srečo največjega števila ljudi, in da bi bilo treba to načelo uporabiti za razlago in vrednotenje pravnih pravil in odločitev.
- Politična etika (1895):V tej knjigi Thomson razpravlja o etičnih temeljih političnih institucij. Trdi, da je država upravičena kot sredstvo za spodbujanje človekove blaginje in da je najboljša oblika vladanja tista, ki najučinkoviteje doseže ta cilj.
- Problem zla (1910):V tem delu Thomson obravnava vprašanje, zakaj je na svetu zlo, če Bog obstaja. Trdi, da zlo ni v neskladju z obstojem dobrohotnega Boga in da ga je mogoče razložiti z načelom svobodne volje in končne narave človeških bitij.
- Zgodovina antične filozofije (1921):Ta knjiga nudi celovit pregled zgodovine filozofije od starih Grkov do srednjega veka. Thomson razpravlja o glavnih filozofih in filozofskih gibanjih tega obdobja ter analizira njihove prispevke k filozofiji.
To je le nekaj del, ki jih je napisal Francis Paul Thompson. Bil je plodovit pisec in njegova dela so pomembno vplivala na razvoj moralne in politične filozofije.