Zgodba se začne tako, da Ben prejme namig v obliki vintage ključavnice s kriptičnim sporočilom. To ga vodi na pustolovščini po vsem svetu po Evropi, kjer mora razvozlati zgodovinske artefakte in najti ključ do skritega trezorja prostozidarjev.
Ob poti se mu pridružita partner Riley Poole in njegov oče Patrick Gates, ki se neradi vključi v iskanje. Soočajo se z nenehnim nasprotovanjem Iana Howeja, rivalskega lovca na zaklad, ki išče isto nagrado, in zvijajočo in skrivnostno žensko po imenu Abigail, ki trdi, da ima svoje razloge za iskanje zaklada.
Potovanje jih popelje v kraje, kot so London, Pariz in Veliki kitajski zid, saj razkrivajo namige, skrite v zgodovinskih dokumentih in mejnikih. V filmu je vznemirljiv vrhunec, kjer mora Ben dirkati proti času, da bi našel zaklad in počistil ime očeta.
Navsezadnje je "National Treasure:Book of Secrets" zabavna, akcijska avantura, ki zgodovinsko spletka združuje s humorjem in srcem. Nadaljuje zapuščino prvega filma, ki ponuja privlačno skrivnost, ki gledalce ohranja angažirane do samega konca.