Ko pa zgodba napreduje, se pojavijo napetosti, ko izbrana skupina prašičev začne manipulirati in izkoriščati svoje soljudi. Konflikt se zaostri, ko prašiči pod vodstvom pretkanega in avtoritarnega merjasca Napoleona začnejo spreminjati sedem zapovedi – vodilna načela kmetije – da bi služili svojim interesom.
Napoleon in njegovi kolegi prašiči postopoma prevzamejo vodilne vloge in vzpostavijo hierarhični sistem, ki jih postavlja nad druge živali. To vodi do globokega razkola znotraj živalske skupnosti, saj Napoleon in njegovi privrženci uživajo privilegije in razkošje, medtem ko se ostale živali trudijo za vzdrževanje farme.
Konflikt se vrti okoli prašičevega prizadevanja za oblast in boja drugih živali, da bi ohranile ideale svojega prvotnega upora. Raziskovanje Živalske farme o izzivih pri spodbujanju resnične enakosti na koncu postane kritika totalitarnih družb in pokvarjenosti na videz plemenitih ideologij.