Pobeg Siriusa Blacka: Knjigo začne novica, da je Sirius Black, nevarni kriminalec in Harryjev boter, pobegnil iz zapora v Azkabanu. Govori se, da Black lovi Harryja, kar dodaja novo raven strahu v že tako stresno okolje.
Novi učitelji in skrivnostni zapornik: V Hogwarts prideta dva nova učitelja:Remus Lupin, učitelj obrambe pred temnimi silami, in profesorica Trelawney, učiteljica vedeževanja. Medtem je skrivnostni ujetnik, domnevno Sirius Black, zaprt v gradu.
Čar pokrovitelja: Harry se od Remusa Lupina nauči močnega pokroviteljskega čara, ki mu pomaga ubraniti dementorje, stražarje Azkabana, ki jih privlačita njegova žalost in strah.
Resnica o Siriusu Blacku: Skozi različne namige in srečanja Harry odkrije resnico o Siriusu Blacku. Bil je lažno obtožen, da je izdal Harryjeve starše Lordu Voldemortu, njegova prava naloga pa je bila zaščititi Harryja.
Soočenje z resnico: Harry se mora soočiti z resnico o smrti svojih staršev in pravimi motivi Siriusa Blacka ter nevarnostjo, ki jo predstavlja za Harryja.
Časovni obračalec: Hermiona uporabi obračalnik časa, da se vrne v preteklost in reši Siriusa Blacka in Buckbeaka, hipogrifa, ki je bil po krivici obsojen na smrt. To vodi do niza dogodkov, ki spremenijo potek zgodbe.
Soočanje z dementorji: Harry, Ron in Hermiona se spopadejo s skupino dementorjev in za obrambo uporabijo čar Patronus.
Prava grožnja: Razkrije se, da je Peter Pettigrew, za katerega so vsi mislili, da je mrtev, dejansko živ in je živel preoblečen v Ronovo podgano Scabbers. Pettigrew je tisti, ki je izdal Harryjeve starše, ne Sirius Black.
Finale: Z razkrito resnico in razkrito pravo nevarnostjo se Harry, Ron in Hermiona soočijo s Petrom Pettigrewom in med tem rešijo Siriusa Blacka. Leto se konča z občutkom olajšanja in novega razumevanja.
Ključne teme: Knjiga raziskuje teme izdaje, prijateljstva, pravičnosti in soočanja s preteklostjo. Predstavlja tudi nove like, čarobna bitja in širi svet magije.