Ojačevalci:To so zaporedja DNK, ki vežejo transkripcijske faktorje in spodbujajo prepisovanje bližnjih genov. Na primer, ojačevalec v lokusu težke verige imunoglobulina je odgovoren za visoko stopnjo izražanja teh genov v celicah B.
Promotorji:To so zaporedja DNA, ki vežejo polimerazo RNA in sprožijo prepisovanje genov. Na primer, promotor v genu človeškega rastnega hormona je odgovoren za izražanje tega gena v hipofizi.
Dušilci:To so zaporedja DNK, ki vežejo transkripcijske faktorje in zavirajo transkripcijo bližnjih genov. Na primer, dušilec v človeškem genu za β-globin je odgovoren za zatiranje tega gena v neeritroidnih celicah.
Transakcijska zaporedja:
Transkripcijski faktorji:To so proteini, ki se vežejo na cis-delujoče sekvence in uravnavajo transkripcijo genov. Na primer, transkripcijski faktor Oct-1 se veže na oktamerni motiv v ojačevalcu težke verige imunoglobulina in spodbuja transkripcijo teh genov v celicah B.
RNA polimeraza:To je proteinski kompleks, ki se veže na promotorje in prepisuje gene v RNA.
Drugi regulatorni proteini:To so proteini, ki se vežejo na cis-delujoče sekvence in na različne načine uravnavajo transkripcijo genov. Na primer, protein CTCF se veže na motiv CCCTC v genu za človeški β-globin in pomaga organizirati kromatinsko strukturo te regije, ki je potrebna za represijo gena v neeritroidnih celicah.