Skrinja velja za najsvetejšo relikvijo Izraelcev in je bila shranjena v Najsvetejšem, najbolj notranjem svetišču tabernaklja. Po 2. Mojzesovi knjigi je bila skrinja zgrajena iz akacijevega lesa in znotraj in zunaj prevlečena s čistim zlatom. Okrog zgornjega roba je imel zlato krono in štiri zlate obroče na štirih vogalih. Dve pozlačeni leseni palici sta bili na eni strani prepeljani skozi obroče in uporabljeni za nošenje skrinje. Skrinja je imela tudi usmiljen sedež ali pokrov iz čistega zlata, na katerem sta bila dva izklesana zlata keruba, obrnjena drug proti drugemu, s krili, ki so se dotikale. in zasenči milostni sedež.
Skrinja je imela odločilno vlogo na potovanju Izraelcev skozi puščavo. Verjeli so, da je prebivališče Boga na Zemlji in je spremljalo Izraelce med njihovim potepanjem. Kadarkoli so postavili tabor, so skrinjo postavili v tabernakelj, in ko so šli naprej, so duhovniki nosili skrinjo, pokrito s prtom, na čelu procesije.
Prisotnost skrinje je Izraelcem prinesla posebno naklonjenost in zaščito. Kadarkoli so skrinjo odnesli v boj, so Izraelci premagali svoje sovražnike. Ko pa so skrinjo ujeli Filistejci, so jih prizadele kuge in skrinjo so morali vrniti. Skrinjo so kasneje izgubili med plenjenjem Jeruzalema s strani Nebukadnezarja leta 587 pr. n. št. in od takrat je niso več videli.
Kje je izgubljena skrinja, je že stoletja predmet ugibanj in fascinacije. Skrinjo so poskušali najti že številni, a nobeden ni bil uspešen. Nekateri verjamejo, da je bila skrinja uničena, medtem ko drugi ugibajo, da je morda skrita v jamah ali podzemnih prostorih v Jeruzalemu ali drugje. Izginotje Skrinje je pripeljalo tudi do številnih legend, zgodb in celo hollywoodskih filmov.