1. Legenda o hrtu: Zgodba se začne z grozljivo legendo o pošastnem hrtu, ki naj bi bil prekletstvo družine Baskerville. Ta nit se sprva zdi zgolj folklora, a kmalu postane jasno, da skriva zloveščo resnico, ki se navezuje na trenutne dogodke in nedavne smrti.
2. Skrivnostna smrt sira Charlesa: Nenadna smrt sira Charlesa, glave družine Baskerville, podžge začetni strah in sum. Prvotno domnevo o srčnem infarktu izpodbijata prisotnost velikega, skrivnostnega odtisa stopala in srhljiva zgodba o strahu sira Charlesa pred smrtjo. Ta nit poganja preiskavo in pripravlja temelje za prihod Holmesa in Watsona.
3. The Strange Behavior of Stapleton: Skrivnostni lik Stapletona, na videz neškodljivega naravoslovca, ki živi blizu Baskerville Halla, je na začetku predstavljen kot prijazen sosed. Toda njegova dejanja, zlasti njegovo zanimanje za legendo o hrtu in njegovo vedenje o smrti Sir Charlesa, vzbujajo dvome o njegovih resničnih namenih. Ta nit vodi do njegovega morebitnega razkritja kot storilca.
Te tri na videz ločene niti se združijo, ko Holmes razvozla skrivnost. Legenda, smrt in Stapletonovo vedenje so povezani z zloveščim načrtom podedovanja posestva Baskerville z umorom. Reševanje uganke vključuje združevanje teh niti, kar doseže vrhunec v razkritju resnične narave hrta in Stapletonovih motivov.