1. Vladna zarota :Bourne je bil prvotno visoko izurjen morilec Cie, znan kot "David Webb." Ko pa se je goljufiva operacija ponesrečila, je utrpel amnezijo in postal civilist brez spomina na svojo preteklost. CIA in druge vladne agencije ga poskušajo odstraniti, da bi prikrile skrivnosti programa Treadstone, tajnega projekta črnih operacij, ki je ustvaril Bourna in druge njemu podobne morilce.
2. Blackbriar :Blackbriar je naslednica organizacije Treadstone, ki so jo ustanovili nekdanji uradniki Cie. Želijo nadzorovati Bourna in uporabiti njegove sposobnosti za lastne tajne operacije. Vendar Bourne postane grožnja njihovim načrtom zaradi svoje neodvisne narave in tveganja, da razkrije njihove dejavnosti.
3. Kiril in ruska vlada :V nekaterih primerih pridejo Bournova dejanja v nasprotje z interesi ruske vlade, še posebej z likom Kirilom. Kirill je visoki ruski obveščevalni častnik, ki se želi maščevati Bournu za pretekla dejanja, ki so vključevala smrt ljubljenih. Bourna ima za osebnega sovražnika in ga skuša odpraviti.
4. Osebna sovražnost :Ko Bourne razkrije resnico o svoji preteklosti in zarotah, ki ga obkrožajo, naleti na posameznike, ki razvijejo osebno maščevanje proti njemu. Ti posamezniki so lahko nekdanji sodelavci ali sovražniki, ki se zaradi Bournovih dejanj počutijo izdane ali krivične, kar jih motivira k maščevanju.
Pomembno je vedeti, da se razlogi za željo po uboju Bourna razlikujejo glede na specifične zaplete knjig ali filmov iz serije Bourne in niso vsi ti razlogi prisotni v vsaki zgodbi.