* Individualne prednosti in slabosti: Različni Pokémoni imajo različne statistike, poteze in sposobnosti, zaradi česar so boljši v različnih scenarijih.
* Usposabljanje in stopnje: Dobro izurjen Pokémon na visoki ravni bo vedno močnejši od tistega na nizki ravni, ne glede na njegovo vrsto.
* Strategija in spretnost igralca: Kako igralec uporablja svoje Pokémone v boju, lahko močno vpliva na njihovo učinkovitost.
Vendar nekateri Pokémoni pogosto veljajo za zelo močne v Pokémon Crystal zaradi svoje močne statistike in premikov:
* Mewtwo: Verjetno najmočnejši Pokémon v celotni franšizi, Mewtwo je psihični tip z neverjetno statistiko in dostopom do močnih potez, kot sta Psychic in Psybeam.
* Tiranitar: Psevdo-legendarni Pokémon z ogromnim napadom in obrambo je Tyranitar sila, s katero je treba računati v bitkah.
* Gyarados: S svojo značilno potezo Dragon Dance lahko Gyarados postane neverjetno močan in pomete cele ekipe.
* Dragonit: Še en psevdo-legendarni Pokémon, Dragonite, je močan leteči/zmajski tip z odličnim gibalnim bazenom.
* Alakazam: Psihični tip z neverjetnim posebnim napadom, Alakazam je lahko neverjetno močan, če se uporablja učinkovito.
* Snorlax: Čeprav je počasen, ima Snorlax neverjetno količino HP in obrambo, zaradi česar ga je težko uničiti.
Navsezadnje je "najmočnejši" Pokémon v Crystalu odvisen od individualnih preferenc, sloga igre in posebnih izzivov, s katerimi se srečujete.