V igri je 25 različnih narav, od katerih ima vsaka svoje pozitivne in negativne učinke na določene statistike. Pokémon s trdoživo naravo na primer nima prilagoditev statistike, medtem ko ima pokémon z veselo naravo povečanje hitrosti in zmanjšanje posebnega napada.
Razumevanje in upravljanje Natures je ključnega pomena pri izgradnji učinkovite ekipe Pokémonov, saj lahko vplivajo na splošne prednosti in slabosti Pokémonov. Igralci lahko med raziskovanjem ječ ali z uporabo funkcije Wonder Mail za povezovanje z drugimi igralci naletijo na Pokémone in jih rekrutirajo s posebnimi naravami.