Fagot je leseno pihalo z dvojnim jezgom, medtem ko je flavta leseno pihalo, na katerega se igra s pihanjem zraka skozi luknjo. Embouchure (postavitev ustnic) in zračni tok, ki sta potrebna za igranje na fagot, se precej razlikujeta od tistih, ki sta potrebna za igranje na flavto, zato učenje igranja na fagot ne bo nič lažje za nekoga, ki se je že učil igranja na flavto. Pravzaprav je morda celo težje, saj se fagot na splošno šteje za zahtevnejši inštrument za učenje kot flavta.