Vendar pa so se skozi stoletja pojavile različne teorije in polemike, ki so se nanašale na Shakespearovo avtorstvo. Nekatere najbolj priljubljene alternativne teorije vključujejo:
* Teorija grofa Oxforda: Ta teorija kaže, da je bil Edward de Vere, 17. grof Oxford, pravi avtor Shakespearovih del.
* Bakonska teorija: Francis Bacon, priznani filozof in državnik, je po tej teoriji predlagana kot pravega pisatelja.
* Marloweova teorija: Ta teorija zasluži Christopher Marlowe, še enega dramatika, kot pravega avtorja Shakespearovih del.
Medtem ko imajo te alternativne teorije svoje argumente, pomanjkanje konkretnih dokazov in prevelik organ naključnih dokazov, ki kažejo na Williama Shakespearea kot avtor, je velika večina učenjakov in kritikov verjela, da je pravi pisatelj.
Pomembno si je zapomniti, da avtorstvo Shakespearovih iger ostaja tema nenehne razprave in razprave.