Njegova smrt je bila posledica usmrtitve s strelskim vodom , ki jo je ukazala boljševiška vlada. Uradni vzrok smrti je bil naveden kot "usmrtitev s strelskim vodom", čeprav obstajajo nasprotujoče si izjave in teorije o posebnih okoliščinah. Nekatera poročila kažejo, da je bila družina ustreljena od blizu, medtem ko drugi trdijo, da so bili najprej ustreljeni in nato pokončani z bajoneti.
Pomembno je omeniti, da se o okoliščinah usmrtitve družine Romanov še vedno razpravlja in izpodbija. Nekateri zgodovinarji trdijo, da je bila usmrtitev nujno dejanje za preprečitev protirevolucije, drugi pa jo vidijo kot brutalen in neupravičen umor. Ne glede na interpretacijo ostaja usmrtitev carja in njegove družine pomemben zgodovinski dogodek, o katerem se še naprej preučuje in razpravlja.