Dobro proti zlu: To je najbolj očitna tema, saj se zgodba vrti okoli bitke med Harryjem Potterjem in Lordom Voldemortom. Vendar pa tema presega preprosto dvojiško datoteko. Zgodba raziskuje naravo dobrega in zla, siva področja, ki obstajajo med njima, in potencial za oboje v posameznikih.
Ljubezen in prijateljstvo: Moč ljubezni je osrednjega pomena v zgodbi in prikazana je kot močnejša od katere koli magije ali zla. Harryjeva ljubezen do prijateljev in družine mu pomaga premagati izzive in na koncu premagati Voldemorta. Poudarjeno je tudi prijateljstvo, saj je Harryjeva vez z Ronom in Hermiono bistvena za njegov uspeh.
Pogum in hrabrost: Harry in njegovi prijatelji se skozi serijo soočajo z neštetimi nevarnostmi in nenehno morajo zbirati pogum, da jih premagajo. Zgodba slavi pogum in odpornost ter kaže, da lahko tudi navadni ljudje dosežejo izjemne stvari, ko se soočijo s svojimi strahovi.
Pomen izbire: Harryjevo življenje je nenehno določeno z odločitvami, ki jih sprejema, tako velikimi kot majhnimi. Zgodba poudarja moč posameznikovih odločitev in odgovornost, ki prihaja z njimi.
Moč prepričanja: Zgodba poudarja, kako pomembno je verjeti vase in v svoje sposobnosti. Harryjeva vera v lasten potencial in vera drugih vanj mu omogoča, da doseže velike stvari.
Sprejemanje smrti: Smrt je ponavljajoča se tema skozi serijo in zgodba raziskuje njene različne vidike. Uči nas sprejeti smrt kot naravni del življenja in najti smisel življenja tudi ob izgubi.
Presodki in diskriminacija: Serija obravnava teme predsodkov in diskriminacije, zlasti skozi ravnanje s hišnimi vilini in drugimi čarobnimi bitji. Poudarja pomen boja za enakost in pravičnost za vse.
Narava družine: Harryjevo iskanje družine in njegovo hrepenenje po pripadnosti sta pomembni temi v seriji. Zgodba raziskuje različne oblike družine, krvne in izbrane, ter pomen ljubezni in podpore.
Čeprav so to nekatere od glavnih tem, obstaja veliko drugih, ki prispevajo h globini in kompleksnosti vesolja Harryja Potterja. Serija vabi bralce, da raziščejo te teme na svoj način ter najdejo pomen in odmev v zgodbi.