Matilda se sooča tudi s težavo spopadanja s tiransko ravnateljico svoje šole, gospodično Trunchbull, katere ostre in zatiralske metode ustvarjajo sovražno okolje za učence. Matilda postane odločena, da se ji upre in s svojimi izjemnimi miselnimi močmi, vključno s telekinezo, razkrije krutost in nesposobnost gospodične Trunchbull ter povzroči pozitivne spremembe v šoli.
Druga težava, s katero se sooča, je pridobitev pravice za gospodično Honey, dobrosrčno učiteljico, s katero je gospodična Trunchbull slabo ravnala. Matildina prizadevanja, da bi pomagala gospodični Honey, sčasoma pripeljejo do odstranitve gospodične Trunchbull in srečnejšega okolja za učence v šoli.