1. Zberite sedem Chaos Emeralds: Ti so razpršeni po ravneh igre in potrebujete vse, da dosežete zadnjo bitko.
2. Na koncu igre se soočite z Dark Gaio: Ko zberete vseh sedem Chaos Emeralds, se boste soočili s Dark Gaio v njeni pravi obliki, ogromno, večglavo zverjo.
3. Uporabite moč Chaos Emeralds: Uporabili boste združeno moč smaragdov, da očistite Dark Gaio. To vključuje uporabo obrazca "Super Sonic", ki se odklene z zbiranjem vseh sedmih Chaos Emeralds.
4. Izvedite čiščenje: Medtem ko ste v formi Super Sonic, boste sprožili močan napad na Dark Gaio. Ta napad ne ubije Dark Gaie, ampak jo namesto tega očisti, svetu povrne ravnovesje in ga vrne v prvotno obliko.
Zgodba igre se osredotoča na idejo obnove namesto popolnega ubijanja. Temna Gaia, čeprav uničujoča, je navsezadnje del svetovnega ravnovesja in cilj je vrniti jo na svoje pravo mesto.