Takole deluje:
1. Začni igro: Ko začnete igrati Pokemon Crystal, boste srečali profesorja Elma v njegovem laboratoriju.
2. Izberite svoj začetnik: Dal vam bo tri žogice Poké, od katerih bo vsaka vsebovala eno od začetnih iger. Izbereš tisto, ki jo želiš.
3. Lov ni potreben: Profesor Elm vam ponudi začetnika, ki ga izberete, tako da vam ga ni treba ujeti, kot bi ga z drugimi Pokemoni.
Kasneje boste imeli priložnost srečati druga dva začetna Pokemona v igri, vendar ju ne boste mogli ujeti. Uporabljali jih bodo drugi trenerji, vi pa jih boste morali premagati v bitki, da boste pridobili njihovo spoštovanje in jih morda dodali v svojo ekipo.