Tukaj je tisto, kar vemo o izumrtju megalodona:
* Najverjetnejši razlog so podnebne spremembe: V pozni miocenski in pliocenski dobi sta se močno ohladili in spremenili oceanski tokovi. To je vplivalo na razpoložljivost Megalodonovega plena, predvsem kitov.
* Konkurenca drugih plenilcev: Pojav drugih velikih plenilcev, kot je veliki beli morski pes, bi prav tako lahko povzročil pritisk na Megalodona.
* Bolezen: Čeprav je manj verjetno, obstaja možnost, da bi bolezen ali parazit prispeval k upadu megalodona.
* Vplivni dogodki: Čeprav to ni neposreden vzrok, nekateri znanstveniki menijo, da so pri izumrtju megalodona lahko vplivali dogodki velikega vpliva.
Pomembno je omeniti, da znanstveniki še vedno razpravljajo o natančnih razlogih za izumrtje megalodona. Vendar je kombinacija zgoraj navedenih dejavnikov splošno sprejeta kot najbolj verjetna razlaga.