1. Animalia: To kraljestvo vključuje vse živali, od najmanjših žuželk do največjih sesalcev. Za živali je značilna sposobnost gibanja, heterotrofni način prehranjevanja (kar pomeni, da hrano dobivajo od drugih organizmov) in spolno razmnoževanje.
2. Rastline: To kraljestvo vključuje vse rastline, od najmanjših alg do največjih dreves. Za rastline je značilna njihova sposobnost, da proizvajajo lastno hrano s procesom fotosinteze, njihov avtotrofni način prehranjevanja (kar pomeni, da jim ni treba jesti drugih organizmov, da bi pridobile svojo hrano) in njihovo razmnoževanje tako spolno kot nespolno.
3. Protista: To kraljestvo vključuje vse protiste, ki so raznolika skupina organizmov, ki ne sodijo niti v živalsko niti v rastlinsko kraljestvo. Protisti so lahko enocelični ali večcelični, lahko so avtotrofni ali heterotrofni in se lahko razmnožujejo tako spolno kot nespolno.
Ta sistem treh kraljestev je predlagal Ernst Haeckel leta 1866 in je bil široko sprejet do šestdesetih let prejšnjega stoletja, ko je bil uveden sistem petih kraljestev.