- "Zakaj križ?" (1901) :
To je njegovo najbolj znano delo, ki predstavlja teološko utemeljitev križanja Jezusa Kristusa in kako to pomeni Božjo ljubezen in milost.
- "The Battleground of the Soul:A Study in the Science of Sanctification" (1903) :
Ta knjiga raziskuje duhovno potovanje kristjana in kako naj si verniki prizadevajo za osebno svetost in zmago v svojih notranjih bojih.
- "The Secret of a Happy Day" (1904) :
Namen te knjige je navdihniti posameznike, da najdejo srečo in zadovoljstvo tako, da se približajo Bogu in sprejmejo življenje duhovne preobrazbe.
- "Življenje, ki zmaga" (1906) :
To delo poudarja pomen vitalnega in zmagovitega krščanskega življenja, poudarja potrebo po močni veri in dosledni predaji Božji volji.
- "Ključ kraljestva" (1907) :
V tej knjigi Johnstone razlaga nauke Jezusa Kristusa in poudarja pomen osebnega učenca in življenja po Božjih zapovedih.
- "The Sure Way of Salvation" (1909) :
To delo nudi preprosto in jedrnato razlago o tem, kako lahko posamezniki dosežejo odrešitev po veri v Jezusa Kristusa.
- "Božja veličina" (1919) :
Ta knjiga se poglablja v veličastvo in suverenost Boga, osredotoča se na njegove lastnosti in njihov vpliv na človeško razumevanje in čaščenje.
- "Križ in njegov pomen" (1930) :
Johnstone ponovno obravnava pomen Kristusovega križanja in razjasni njegove večplastne posledice za človeško odrešitev in spravo z Bogom.
To je nekaj pomembnih spisov Johna Chalmersa Johnstona, ki prikazujejo njegovo teološko globino in duhovni vpliv, ki ga je imel na številne bralce skozi leta.