Séguy se je rodil 1. julija 1877 v Toulonu v Franciji. Že v mladosti je pokazal strast do naravne zgodovine in je začel zbirati žuželke pri 12 letih. Študiral je medicino na univerzi v Montpellieru in leta 1902 diplomiral.
Séguy je svojo kariero začel kot vojaški zdravnik, a se je kmalu posvetil entomologiji. Od leta 1906 do upokojitve leta 1942 je delal v Muséum national d'histoire naturelle v Parizu. V času svojega dela v muzeju je skrbel za zbirko Diptera in objavil številne znanstvene članke in knjige na to temo.
Séguyjevo glavno raziskovalno področje je bila družina Muscidae in postal je svetovni strokovnjak za to skupino. Opisal je več kot 1000 novih vrst Muscidae in izdal več monografij in katalogov o družini. Delal je tudi na drugih družinah Diptera, vključno s Tephritidae, Conopidae in Cecidomyiidae.
Poleg znanstvenega dela je bil Séguy tudi aktiven član več znanstvenih društev, vključno z Société entomologique de France in Royal Entomological Society of London. Leta 1939 je bil nagrajen z Linneanovo medaljo Linneanskega društva v Londonu in nagrado Prix Constant s strani Académie des sciences v Parizu leta 1949.
Séguy je umrl v Parizu 23. oktobra 1951 v starosti 74 let. Bil je ploden entomolog, ki je pomembno prispeval k preučevanju Diptera, njegovo delo pa znanstveniki še danes pogosto citirajo.