Besedilo opisuje vihravo romanco, ki se je sprva zdela popolna, a je kmalu razkrila svojo temno plat. Pripovedovalka poje o tem, kako je že od začetka vedela, da obstajajo rdeče zastavice, vendar jih je prezrla zaradi intenzivnih občutkov, ki jih je imela do te osebe.
V celotni pesmi Swift uporablja metaforični jezik in podobe, da prenese čustveni nemir razmerja. Svojo ljubezen primerja z "rdečim prekletstvom" in "drogo", s katero je bila zasvojena, čeprav je vedela, da je škodljiva.
Refren poudarja pripovedovalkino spoznanje, da je bila čez glavo in bi morala videti težave, ki prihajajo:"Vedel sem, da si težava, ko si vstopil, zato me je zdaj sram."
Most pesmi se dvigne do vrhunca, ko pripovedovalka izrazi svoje razočaranje in jezo ter si želi, da bi se lahko vrnila in razveljavila svojo odločitev, da se zaplete s to osebo. Zaveda se, da se je pustila zaslepiti svojim občutkom in je za to plačala ceno.
Končni refren ponavlja glavno sporočilo pesmi in krepi idejo, da je pripovedovalka vedela, da je njena ljubezen v težavah, a se je kljub temu pustila ujeti vanjo.
Na splošno "I Knew You Were Trouble" služi kot opozorilna zgodba o nevarnostih ignoriranja rdečih zastavic in prepuščanja intenzivnim čustvom v razmerju, kar vodi do morebitnega zlomljenega srca in obžalovanja.