Mozart in Schikaneder sta pri ustvarjanju opere tesno sodelovala. Delo sta si sprva zamislila kot pravljično opero, sčasoma pa se je razvilo v bolj resno in kompleksno delo, ki je raziskovalo teme ljubezni, prijateljstva ter iskanja modrosti in razsvetljenja.
Mozartovo glasbo za Čarobno piščal odlikujejo lepota, raznolikost in čustvena globina. Opera vsebuje široko paleto glasbenih številk, vključno z arijami, dueti, ansambli in zbori, pa tudi instrumentalne odlomke, ki povečajo dramatiko zgodbe.
Uspeh Čarobne piščali je Mozartu zagotovil sloves enega največjih opernih skladateljev. Še naprej jo redno izvajajo po vsem svetu in velja za eno mojstrovin operne literature.