Televizija:
* Moški, ki se slabo obnašajo (1992-1998): Ta situacijska komedija je Clunesa izstrelila v glavni uspeh, ko je igral očarljivo nesrečnega Garyja.
* Doc Martin (2004-danes): Morda Clunesova najbolj ikonična vloga, igra osornega, a ljubkega zdravnika v mestu Portwenn v Cornwallu.
* Reggie Perrin (2007-2009): Remake klasičnega britanskega sitcoma "Vzpon in padec Reggieja Perrina".
* The Great Escape (2003): Miniserija v dveh delih, kjer je Clunes upodobil Rogerja Bushella.
* Jonathan Creek (2000-2016): Pojavil se je v več epizodah te skrivnostne serije kot najboljši prijatelj glavne junakinje, Maddyjin mož.
* Poveljnik (1998-2000): Igral je glavno vlogo poveljnika Jacka Harperja, častnika kraljeve mornarice.
* William in Mary (2003-2010): Pojavil se je kot ponavljajoči se lik, svak glavnega lika.
* Palača (2008): V tej satirični humoristični seriji je igral vlogo člana kraljeve družine.
* Manhunt (2019): V tej resnični kriminalistični seriji o ujetju Levija Bellfielda je upodobil glavnega tajnika Colina Suttona.
* Kraljičin nos (2001): V tej otroški seriji je izrazil lik govorečega psa, "Kraljičin nos".
Filmi:
* Utrip srca (1992): Clunes je igral v filmski različici priljubljene serije ITV.
* The Lakes (2000): Romantični triler, kjer Clunes igra moškega, obsedenega z žensko.
* Časovni stroj (2002): Igral je vlogo Alexandra Hartdegena, znanstvenika, ki potuje v prihodnost.
* Zadnji detektiv (2003): Detektivski triler, ki temelji na seriji romanov avtorja Michaela Connellyja.
* Three and Out (2011): Črna komedija, kjer Clunes igra ostarelega nogometaša.
* Legenda o Barneyju Thomsonu (2015): Črna komedija, kjer Clunes igra brivca, ki po nesreči postane serijski morilec.
* SuperBob (2015): Igral je človeka blage narave, ki je prisiljen postati superjunak.
To ni izčrpen seznam, vendar vključuje nekaj njegovih najbolj opaznih in najbolj znanih projektov.