V tej seriji se glavni lik, Mikey Kudo, in njegovi prijatelji prenesejo v digitalni svet in se povežejo s partnerji Digimon. Toda namesto da bi bili neposredno preoblikovani, se "zlijejo" s svojim Digimonom, kar ima za posledico hibridno obliko človek-Digimon, imenovano "Fusion Fighters". To jim omogoča, da izkoristijo Digimonove sposobnosti in se borijo skupaj z njimi.
Serija raziskuje teme prijateljstva, timskega dela in premagovanja izzivov med krmarjenjem po nevarnostih digitalnega sveta.