- Slabo pomorsko znanje: Drakeova zgodnja potovanja so zaznamovala slaba pomorska znanja in nepremišljene odločitve, ki so privedle do izgube več ladij in članov posadke.
- Pomanjkanje izkušenj: Drake je imel malo izkušenj z vodenjem velike flote ladij, njegove posadke pa so bile pogosto neizkušene in nedisciplinirane.
- Slabo vreme: Drakova potovanja je pogosto pestilo slabo vreme, vključno z nevihtami in meglo, zaradi česar sta bila navigacija in jadranje nevarna.
- Bolezen: Bolezen je bila stalna grožnja Drakovim posadkam in številni mornarji so umrli zaradi skorbuta, dizenterije in drugih bolezni.
- Sovražni domorodci: Drake je v mnogih delih sveta naletel na sovražna domorodna plemena in pogosto se je bil prisiljen bojevati, da bi branil svoje ladje in posadke.
- Španske vojne ladje: Španci so bili Drakov glavni sovražnik in poslali so več vojaških ladij, da bi ga lovile in uničile njegovo floto.