Španska armada je bila ogromna flota ladij, ki jo je španski kralj Filip II poslal v invazijo na Anglijo leta 1588. Drake je bil eden od poveljnikov angleške flote, ki je premagala Armado.
2. Portugalska mornarica
Portugalska mornarica je bila še ena velika grožnja Drakovim ekspedicijam. Portugalska je bila takrat močna pomorska sila, njena mornarica pa dobro opremljena in izurjena. Drake se je večkrat spopadel s portugalsko mornarico in pogosto je bil številčno premočen in orožniški.
3. Indijanci
Drake se je moral boriti tudi z Indijanci, ki so živeli na območjih, ki jih je raziskoval. Ameriški domorodci so bili pogosto sovražni do Angležev in včasih so napadli Drakove ladje.
4. Vreme
Drake se je moral spopasti tudi z vremenom. Morja okoli Južne Amerike so lahko zelo razburkana in Drakove ladje so pogosto zajele nevihte.
5. Bolezen
Bolezen je bila stalna grožnja za Drakea in njegovo posadko. Številne bolezni, ki so bile pogoste v tropih, so bile usodne in Drake je zaradi bolezni izgubil veliko ljudi.
6. Upor
Leta 1578 se je Drakova posadka uprla proti njemu. Upor je vodil Thomas Doughty, ki je bil Drakov drugi poveljnik. Doughty je bil na koncu usmrčen in upor je bil zatrt.
Kljub vsem tem oviram je Drake uspel dokončati svojo obkrožitev sveta. Bil je spreten navigator in drzen raziskovalec ter velja za enega največjih pomorščakov v zgodovini.