Ena od teorij pravi, da so balalajko izumili sami Rusi. To temelji na dejstvu, da je balalajka tradicionalno rusko glasbilo in obstajajo dokazi o njenem obstoju v Rusiji že v 17. stoletju.
Druga teorija pravi, da je balalajko izumila skupina ruskih glasbenikov, znanih kot guslarji. Guslarji so bili potujoči glasbeniki, ki so igrali na različna godala, tudi na balalajko. Menijo, da so razširili znanje o balalajki po vsej Rusiji.
Nazadnje, nekateri verjamejo, da je balalajko morda izumil moški po imenu Vasilij Andrejev. Andrejev je bil ruski glasbenik in skladatelj, ki je živel v poznem 19. in zgodnjem 20. stoletju. Zaslužen je za popularizacijo balalajke in nanjo opozoril svet.
Navsezadnje pravi izumitelj balalajke morda nikoli ne bo znan. Vendar pa ima instrument dolgo in bogato zgodovino in nanj še vedno igrajo glasbeniki po vsem svetu.